由于食品加工废水中的高浓度有机物易生物降解，且无毒性，在食品废水处理中常采用厌氧生物处理工艺。厌氧处理动 力消耗低，并能产生生物能—沼气，由于厌氧处理是在无氧状态下进行，所以在反应过程中应采取密封处理，不污染外界环境。厌氧生 物处理产生的剩余污泥量较少，同时反应可不连续进行，剩余的污泥可长期保存，因此，厌氧生物处理相比于好氧生物处理具有投资 省、不污染环境、产能等特点。
但是，厌氧生物处理对于氮、磷的去除率较低，所以出水往往无法达到直接排放水体的要求，需和一些 好氧工艺相结合以达到废水排放的要求。 与好氧生物处理工艺类似，厌氧生物处理工艺也可分为厌氧活性污泥法和厌氧生物膜法。厌氧活性污泥法包括厌氧 接触消化法、上流式厌氧污泥床(UASB)、水力循环厌氧接触池、膨胀颗粒污泥床(EGSB)等，厌氧生物膜法包括厌氧生 物滤池(AF)、厌氧生物转盘、厌氧膨胀床、厌氧硫化床等。厌氧生物处理工艺在中温或高温条件(35℃或55 ℃)下处理 效果较好，但是，上流式厌氧污泥床、厌氧生物滤池在常温15～300℃，有机负荷小于5.0kgCOD/(m3·d)时，COD去 除率仍可以达到80%以上，目前，这两种工艺多用于食品加工废水的处理。
由于食品加工生产过程产生的废水量大，其成分复杂多变，单一的处理工艺对不同污染物处理效果不同，采用任何 一种处理工艺处理食品加工废水一般不能满足其排放要求，所以在实际工程中常常结合两种或两种以上的处理工艺相 结合的组合处理法处理食品加工废水，充分发挥各种处理方法的优势，达到废水处理高效、高负荷、抗冲击的目的。 包括有气浮法与活性污泥法相结合的组合工艺、化学法和生物法相结合的组合工艺、厌氧法和好氧法相结合的组合工 艺、生物膜法和活性污泥法相结合的组合工艺等。
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